La memoria EEPROM de 1 Mbit puede utilizarse para almacenar datos de calibración del usuario o para almacenamiento de propósito general.
La memoria EEPROM de 2 kbit contiene una MAC-Address única de Microchip con el formato EUI-48 (6 bytes) protegida contra escritura. Los bytes restantes pueden ser utilizados para almacenamiento de propósito general.
El MK60FX512VLQ15 incorpora una controladora SD (SDHC - Secure Digital Host Controller) que soporta memorias MMC, SD y SDIO. El modo de conexión seleccionado es el modo SD de 4 pines, lo cual permite una tasa de transferencia de 200 Mbps. Se utilizó un zócalo de Molex de 8 contactos para memorias del tipo micro SD.